2006 年，总部位于芝加哥的对冲基金的创始人私人收藏家以8000万美元的价格从私人手中购买了 False Start（1959 购买利伏昔安 年），使其成为在世艺术家最昂贵的画作。 2014年11月11 日，1983年版本的Flag在纽约苏富比以3600美元的价格拍卖，刷新了琼斯的拍卖纪录。 2010 年，《旗帜》（1958 年），其中一个系列，以 1.1 亿美元（当时 7300 万英镑；8170 万欧元）的价格私下卖给了对冲基金亿万富翁。 卖家是一位传奇经销商的儿子，他于1999年去世。 虽然双方没有透露价格，但艺术专家表示，科恩支付了约1.1亿美元。 这位艺术家在1954年至1955年间绘制了他的第一面美国国旗，这幅作品现收藏于现代艺术博物馆。 琼斯的《错误开始》(False Start)曾创下了在世艺术家作品最高拍卖价记录，2006 年秋天，它以八千万美元被不知名买家购得收藏。
在琼斯完成一幅油画以后，经常会出产同样的版画。 这些草图有时候会变成不同的版画，这就是琼斯很多版画虽然有同一图像但是很多时候不同的版本有细微的差异和修改。 在瓊斯完成一幅油画以后，经常会出产同样的版画。 这些草图有时候会变成不同的版画，这就是瓊斯很多版画虽然有同一图像但是很多时候不同的版本有细微的差异和修改。 琼斯的作品有时与新达达主义和波普艺术组合在一起：他使用马塞尔杜尚现成品的达达传统中的符号，但与安迪沃霍尔等许多波普艺术家不同，他不参与名人文化。 其他学者和博物馆将琼斯和劳森伯格定位为波普艺术的前身。 琼斯的艺术理念受到杜尚的影响，杜尚对于艺术本身的标志性质疑，不止对琼斯，对美国现当代艺术的发展都贡献巨大。 在达达艺术中生活之物被用来作为嘲讽传统艺术的武器，体现的是艺术家的幽默感。
瓊斯的大型油画由于其稀有程度和历史重要性一直是世界各地当代艺术藏家所梦寐以求的作品，也是非常难得到的收藏。 他的作品被美国和欧洲最重要的艺术博物馆收藏，其中包括：美国国家美术馆、惠特尼美国艺术博物馆、纽约现代艺术博物馆、大都会艺术博物馆（MET）、伦敦泰特现代美术馆、巴黎蓬皮杜艺术中心。 也许琼斯意识到观者的力量，也许他认为可以开始进行新的拓展，所以，之后他的创作范畴明显扩大了，除了流行图像，琼斯还选择了许多他遇到的事物作为创作对象，比如他开车时瞥见墙上的一块石板。 地图也是他著名的系列之一，在现实和抽象图式之间，黑白和三原色慢慢占据谜一般的未开垦地带，琼斯将这块地带重现在画布上。 本质上来看，所有的地图都是现实生活中某些东西的抽象符号。 然而，琼斯坚持：这幅画本身就是一张地图，而不是对某个地图的再现。 其最著名的作品是 旗帜（1954年-1955年），此作品是由他梦见的美国国旗所启发而作的。 提及琼斯的作品，不可绕过的是他在拍场上创造出的神话，作品《错误开始》(False Start)曾创下了在世艺术家作品最高拍卖价记录，在2006 年，作品以八千万美元被不知名买家购得。
回顾他的艺术生涯，琼斯用他的艺术理念赋予其作品各种先锋意义，他通过对已定义物件的再定义，从而展示一系列除此件事物本身含义以外所带来的熟悉的引申含义。 而手法也十分独特，他用手印脚印、演员的身体部位，或在他的工作室的物体，如锡罐的边缘等等。 琼斯最出名的是他的一系列旗帜、地图、目标、字母和数字，这是他在 1954年烧毁了他以前的所有作品后开始的实践。 他对已定义或现存符号的使用使他的绘画与抽象表现主义者的手势抽象区分开来，后者的绘画通常被理解为表达艺术家的个人个性或心理。 他以描绘美国国旗和其他与美国相关的主题而闻名。 约翰的作品经常在拍卖会上以数百万美元的价格出售，其中包括据报道2010年的1.1亿美元的拍卖。 约翰的作品多次被评为当代艺术家作品的最高报酬。
不过，据评论家称，1978 年他在纽约举办展览后，以名为《四季》的四幅作品系列开辟了新局面，这些画作尺寸为 1.9 米 x 1.